با این حال محمود کلهر گزینه اول پرسپولیسی‌ها برای مدیریت تیم‌های پایه است. محمود کلهر قبلاً هم هدایت آکادمی باشگاه پرسپولیس را در سال‌های میانی دهه هشتاد و آکادمی باشگاه راه آهن را در سال‌های ابتدایی دهه نود بر عهده داشت. در طی دوره‌ی مدیریت کلهر، نفراتی مثل علیرضا حقیقی، برادران محمدی و علی علی پور به تیم‌های بزرگسالان دو باشگاه راه یافتند.

کلهر در دوران مدیریت خود در تیم‌های پایه نتایج خوبی با این تیم‌ها گرفت و مربیانی مثل محسن عاشوری، مرحوم فریبرز مرادی، مجتبی محرمی و… در دوران حضور او در تیم‌های پایه باشگاه پرسپولیس فعالیت می‌کردند.

کلهر ۵۷ ساله بازیکن سابق تیم‌های فوتبال پاس تهران، استقلال و پرسپولیس است و توانسته است به شکلی جالب توجه با هر 3 تیم مورد اشاره در مسابقات فوتبال لیگ کشورمان عنوان قهرمانی را به دست آورد. او د ر زمانی که خودش هم بازی می‌کرد از ستاره‌های تیم‌های پایه بود و عنوان آقای گلی مسابقات فوتبال باشگاه های تهران در رده جوانان را در سال 1364 با تیم فوتبال استقلال به دست آورد.