براساس اطلاعیه معاون درآمدهای مالیاتی سازمان امور مالیاتی کشور، مالیات ارزش افزوده دریافتی توسط مودیان باید به منظور محاسبه مالیات عملکرد از رقم فروش مودی کسر شود.
با توجه به مکاتبه معاونت درآمدهای سازمان امور مالیاتی کشور با ادارات کل امور مالیاتی، مبلغ دریافتی مالیات و عوارض ارزش افزوده مودیان که ناشی از فروش کالاها و خدمات مشمول مالیات ارزش افزوده است، نباید در محاسبه مالیات عملکرد اشخاص مورد توجه قرار گیرد.
در مکاتبه معاونت درآمدهای سازمان امور مالیاتی با ادارات کل امور مالیاتی کشور به تاریخ 26 آبان ماه آمده است:
مودیان مشمول نظام مالیات بر ارزش افزوده که در اجرای مفاد 2 و 14 مکرر قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان از پایانه فروشگاهی، ابزار پرداخت، دستگاه کارتخوان بانکی استفاده می‌کنند، رقم واریزی شامل اصل بهای کالا و مالیات و عوارض ارزش افزوده با نرخ معین می‌باشد. لذا ماموران مالیاتی به هنگام رسیدگی به مالیات بر درآمد این مودیان مراتب را مد نظر داشته باشند.
لازم به ذکر است، به موجب تبصره 4 ماده 14 مکرر قانون پایانه‌های فروشگاهی و سامانه مودیان، رسید دستگاه کارتخوان بانکی یا درگاه پرداخت الکترونیکی که عرضه‌کننده کالا و خدمات واحد هستند یا کالاهای و خدمات مورد عرضه آنها مشمول نرخ مالیات ارزش افزوده یکسان است، به عنوان صورت حساب الکترونیکی محسوب می‌شود.
